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實時熒光定量PCR的優(yōu)化(二)
發(fā)布時間: 2021-10-12 點擊次數(shù): 1134次如果你所研究的靶序列有前人建立過實時熒光定量PCR的方法,就可以在公共數(shù)據(jù)庫中查找,查看擴增效率、特異性、靈敏度等信息,省去從頭開始的時間。
注意,使用前人建立的方法前,需要再次驗證這個方法的參數(shù)是不是符合描述。防止長時間重復實驗,卻得不到想要的結果的人間慘劇。
推薦的公共引物探針數(shù)據(jù)庫:
1、RTPrimerDB
這個數(shù)據(jù)庫內(nèi)的約6000個基因,來自人、擬南芥、大鼠等21個物種,相對其他數(shù)據(jù)庫豐富。這些引物和探針,也是經(jīng)過驗證的,70%已發(fā)表。使用該數(shù)據(jù)庫時建議通過網(wǎng)絡代理登錄。
2、PrimerBank
這個數(shù)據(jù)庫內(nèi)的探針引物是通過算法設計得到的,主要包括人和小鼠的基因。數(shù)據(jù)庫內(nèi)的小鼠引物,經(jīng)過廣泛驗證后,被證實有83%的成功率。
3、Real Time PCR Primer Sets
這個數(shù)據(jù)庫內(nèi)的引物和探針都經(jīng)過測試、優(yōu)化,針對多種生物設計,包括人、小鼠、大鼠等的基因。
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